جوشکاری با خطرات ناشی از استفاده از جریان ، گاز تحت فشار ، گرما و انتشار تابش نور و مواد مضر همراه است. خطر به فرآیند جوشکاری مورد استفاده بستگی دارد.
مواد مضر به شکل جوش دود و گاز از فلزات مذاب به ویژه از فلزات پرکننده مذاب آزاد می شوند. فلز به دلیل گرمای بیش از حد ذوب یا فلز پرکننده تبخیر می شود. بخار از ذوب بالا می رود ، خنک می شود و ذرات فلزی را با تراکم تشکیل می دهد. ذرات فلزی موجود در هوا دود جوش نامیده می شوند. ترکیب دوده به ترکیب مواد جوش داده شده بستگی دارد. دود آزاد شده در هنگام جوشکاری فولادهای غیر آلیاژی و کم آلیاژ ، عمدتاً از آهن و منگنز یا اکسیدهای آنها تشکیل شده است. هنگام جوشکاری مواد آلومینیومی ، دود عمدتا از آلومینا تشکیل شده است و جوشکاری فولاد ضد زنگ مقاوم در برابر خوردگی ترکیبات نیکل و کروم را آزاد می کند. استنشاق ترکیبات آهن و آلومینیوم می تواند مجاری تنفسی را فشرده کرده و به عملکرد ریه آسیب برساند. مسمومیت حاد ناشی از استنشاق گرد و غبار با مقادیر منگنز بسیار زیاد می تواند باعث التهاب ریه ها شود.